Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HIRIP3Q9BW71 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms