Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf88Q9BSF0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C2orf88Q9BSF0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms