Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms