Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms