Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms