Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GAL3ST1Q99999 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms