Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EYA3Q99504 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms