Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms