Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms