Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms