Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms