Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EP400Q96L91 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms