Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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