Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms