Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms