Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms