Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms