Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms