Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM4SF18Q96CE8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms