Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms