Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC47Q96A33 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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