Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms