Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms