Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms