Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSAMQ8N6F7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms