Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF1Q8N6C5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF1Q8N6C5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF1Q8N6C5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF1Q8N6C5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF1Q8N6C5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF1Q8N6C5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms