Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf62Q8N4C0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf62Q8N4C0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms