Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNL1Q8IU54 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms