Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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