Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms