Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L3Q6VB84 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms