Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR2Q6VAB6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR2Q6VAB6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms