Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMBOX1Q6NT76 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms