Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms