Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46CQ5VWP2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms