Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF20Q5VTR2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms