Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms