Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms