Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms