Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms