Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms