Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms