Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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