Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms