Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC184Q52MB2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC184Q52MB2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms