Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
QSER1Q2KHR3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms