Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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