Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms