Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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