Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SYCP1Q15431 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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